Muudatused on samuti vajalikud selleks, et täita partnerlusleppe Euroopa struktuuri- ja investeerimisfondide kasutamiseks 2014–2020 eeltingimusi tervishoiu valdkonnas. Partnerluslepe näeb ette, et rakendatud on riiklik ja/või piirkondlik tervishoiu strateegiline poliitikaraamistik, mis sisaldab kooskõlastatud meetmeid tervishoiuteenuste ligipääsetavuse parandamiseks. Antud kriteeriumi täitmiseks on vajalik tervishoiu arengusuundade täpsem käsitlus arengukava rakendusplaanis, sh infrastruktuuri vajadus ja teenuseosutajate võrgu ümberkorraldamine. Tegevused peavad olema kooskõlastatud Euroopa Regionaalarengu Fondi 2014-2020 perioodil kavandatavate tegevustega.
Seega käsitlevad rakendusplaani muudatused tegevusi, mis on vajalikud haiglavõrgu korrastamiseks (haiglate võrgustumine ja eriarstiabi osutavate haiglate koondumine ühtse sisulise juhtimise alla) ja haiglate infrastruktuuri kaasajastamiseks. Samuti viiakse rakendusplaani sisse tervishoiusüsteemi arenguks vajalikud inimressursi ja teenuste arendamise tegevused.