Erakorralise meditsiini osakondi hakati Eesti haiglate juurde looma aastatuhande vahetusel. Valdavalt hakkasid need paiknema endiste vastuvõtutubade ruumides. Vana ja uue süsteemi põhimõtted patsientide vastu võtmisel olid erinevad. Kui varem registreeriti patsiendid haiglasse ja jaotati vastavalt profiilile kas kirurgia, sisehaiguste vms tubadesse, siis uues süsteemis hakkas patsientide jaotus baseeruma sellel, kui kiireloomuline on juhtum, kui raskes seisus on haige, millised esmased uuringud peaks tegema kohe haige saabudes, kuhu osakonda patsient hospitaliseerida või kas piisab sellest, et anda esmaabi ja suunata kodusele ravile.