Taasiseseisvumise järel, kui Tallinna tehnikaülikoolis (TalTech) hakati õpetama meditsiinitehnikat ja Tartu ülikoolis oli õpe keskendunud meditsiinifüüsikale, toimis kahe ülikooli ühisõppekava aastatel 2013–18 hästi. See aga ei jäänud kestma ning meditsiinitehnika ja -füüsika õppekava jäi tervikuna TalTechi. Instituudi praegune eesmärk on suurendada tõenduspõhiste ja jätkusuutlike tervisetehnoloogiate kättesaadavust nii Tallinnas ja Tartus kui ka väiksemates linnades, e-tervise õppekava näitel ka üle kogu maailma.