Jaana Sepa varasem töökogemus hõlmab avalikku sektorit, kaitsevaldkonda ning kõrgharidust. Enne
Tallinna tervishoiu kõrgkooliga liitumist töötas ta kümme aastat kaitseväe toonases logistikakeskuses mitmesugustel juhtivatel ametikohtadel ning kaks aastat Raasiku vallavalitsuse majandusosakonnas. Kõrgkoolis on ta töötanud nii õppejõu kui ka õppeosakonna juhatajana, omandades põhjaliku kogemuse õppekorralduse, õppekvaliteedi juhtimise ning kõrgkooli arendustegevuse valdkonnas.