Helsingi ülikooli apteegiketi Yliopiston Apteekki ning kümneüksiku apteegi baasil loodud ja soomlastele kuuluv apteegiketiÜlikooli Apteek OÜ vahel on käimas kaks vaidlust kaubamärgiÜlikooli Apteek osas.
Esimeses vaidluses nõuab Yliopiston Apteekki Ülikooli ApteekOÜ-lt vaidlusaluse kaubamärgi kasutamise lõpetamist ja teises onYliopiston Apteekki vaidlustanud sama kaubamärgi registreerimiseÜlikooli Apteek OÜ nimele. Mullu novembris peatas ringkonnakohuskaubamärgi kasutamise vaidluse menetluse kuni kaubamärgiregistreerimise vaidluse lõppemiseni osapoolte vahel.