Möödunud aastal olid haigekassa tulud 11,4 miljardit krooni. Tulude eelarve täideti 95%, alalaekumine oli 590 miljonit krooni. Võrreldes 2008. aastaga vähenesid tulud 11%. Raske majanduslik olukord on ka põhjus, miks otsustati haigekassa juhatuse liikmetele tulemustasusid eelmise aasta eest mitte maksta.
Haigekassa kulud olid 2009. aastal kokku 12,1 miljardit krooni. Kulud vähenesid 2008. aastaga võrreldes 2%, kulude eelarve täideti 99%. Kindlustatute arv 2009. aasta lõpus oli 1 276 366, millest töötavate kindlustatute arv moodustas 46%, kindlustatutega võrdsustatud isikuid (rasedad, kuni 19-aastased isikud, pensionärid, üliõpilased jms) oli 47% ja riigi poolt kindlustatuid (töötud, ajateenijad, alla 3-aastase lapse vanemad jne) 7%.