Nii rahandus- kui sotsiaalministeerium ei toeta eelnõu. Rahandusministeerium leiab, et võrdse kohtlemise põhimõtet saab rakendada vaid sarnases olukorras olevatele gruppidele. FIE iseseisvuse määr on oluliselt suurem, kui alluvussuhtes oleval palgatöötajal, mistõttu on FIE ja töötajate puhul tegemist oluliselt erinevates olukordades olevate isikutega. Arvestades FIE tegevuse olemust ei pruugi haigestumisest tingitud paus automaatselt tähendada tulu vähenemist. Haigushüvitis on aga haiguse tõttu saamata jäänud tulu hüvitis.
Sotsiaalministeerium leiab, et tööandja makstava haigushüvitise eesmärk on motiveerida tööandjat majanduslikult panustama töökeskkonna parandamisse ning panna teda enam huvituma ettevõtte sotsiaalse vastutusega seonduvatest meetmetest. Tööandja makstav haigushüvitis ja haigushüvitis ravikindlustuse seaduse alusel ei ole samastatavad.