Tsentraalne uneapnoe on üliharva esinev sündroom. Kui obstruktiivset uneapnoed esineb 95-99%, siis tsentraalset uneapnoed 1-5%. Kui obstruktiivsele uneapnoele on iseloomulik ülemiste hingamsiteede sulgumine une ajal, siis tsentraalsele uneapnoele hingamispüüde puudumine, mis kestab 10 sekundit või kauem: hingamislihaste närviülekanne on kadunud.